常用的厭氧反應器是升流式活性污泥床(UASB)，作為第二代的厭氧反應器，在工藝上具有厭氧反應過來和厭氧活性污泥雙重優勢，能夠將廢水中的有機污染物轉化成再生清潔能源-沼氣使用。在進行污水處理的同時，對廢氣進行脫硫處理，能夠實現節能環保的目的。

　　UASB之所以應用廣泛，主要是因為它性能穩定，水力混合條件良好，可以模塊化拼裝，能夠大幅降低現場安裝和調試的時間。除了用于制藥廢水外，還可以用在食品、生物、造紙和印染等行業的廢水處理。IC反應器是在UASB反應器的基礎上開發出來的第三代高效厭氧反應器，這個工藝克服了UASB反應器處理中低濃度廢水負荷和大量產氣所造成污泥流失的問題，活性污泥利用率更高。

　　UASB反應器在工作的時候，是將廢水經過調節后，均勻的引入到反應器的底部。廢水在反應器內不斷上升，會通過絮狀污泥的污泥床。厭氧反應就發生在絮狀污泥的活性微生物和廢水的有機污染物之間。在接觸的過程中，會產生大量的主要成分為甲烷和二氧化碳的氣體。氣體在廢水中上升的過程中，會攜帶活性污泥顆粒一起上升，起到了攪拌的作用，引起內部水力循環。帶著活性污泥顆粒的氣體上升到反應器頂部時，碰撞到三相分離器的擋板時，污泥顆粒會重新返回沉淀到污泥床上，氣體會經過頂部的集氣室收集。要保持UASB的高效運行，必須具備良好的截留活性污泥的性能，保證反應器內有足夠的活性微生物。其次，活性污泥要和廢水有機污染物進行混合充分接觸反應。

　　IC反應器也稱為厭氧內循環反應器，是基于UASB反應器顆粒化和三相分離器而改進的高效反應器。充分利用了活性污泥的特點，底部的處理負荷高，頂部的負荷低。在活性污泥床上包含了專門培養的厭氧微生物，污泥床在反應中由于上流、回流、產氣等會使得污泥膨脹，廢水和污泥顆粒之間能夠有效接觸，并保持微生物的高活性，才能有較強的有機負荷和轉化率。在頂部反應區，廢水上流速度較慢，和污泥顆粒接觸的時間較長，生物可降解的COD在這部分去除率增加。相當于兩個串聯的UASB反應區單元相互疊加，內部的回流是利用氣提作用而進行的，回流比例可以根據廢水反應的產量來決定。